নাটোর জেলা প্রশাসনের সাংগঠনিক কাঠামো নিন্মরুপঃ
জেলা প্রশাসকের কার্যালয়ের প্রধান হিসেবে আছেন একজন জেলা প্রশাসক, তার পরে আছেন একজন উপ-পরিচালক, তারপরে আছেন তিন জন অতিরিক্ত জেলা প্রশাসক। উপ-পরিচালক এর অধীনে আছে একটি স্থানীয় সরকার বিভাগ। অতিরিক্ত জেলা প্রশাসক সার্বিক-এর অধীনে আছে সাধারণ শাখা, নেজারত শাখা, আইসিটি শাখা, ট্রেজারী শাখা, সংস্থাপন শাখা, ই-সেবা শাখা। অতিরিক্ত জেলা প্রশাসক (রাজস্ব) -এর অধীনে আছে রাজস্ব শাখা, এলও শাখা, সার্টিফিকেট শাখা, রেভিনিউ মুন্সিখানা শাখা। অতিরিক্ত জেলা ম্যাজিস্ট্রেট এর অধীনে আছে জুডিশিয়াল মুশাখানা শাখা।
পরিকল্পনা ও বাস্তবায়নে: মন্ত্রিপরিষদ বিভাগ, এটুআই, বিসিসি, ডিওআইসিটি ও বেসিস