নাটোর জেলার যোগাযোগ ব্যবস্থা প্রধানত ২ ধরনের। যথাঃ
১। সড়ক পথ
২। রেল পথ
সড়ক পথে রাজধানী ঢাকাসহ দেশের প্রায় সকল অঞ্চলের সাথেই এ জেলার যোগাযোগ ব্যবস্থা আছে। এই পথে ঢাকা থেকে নাটোর জেলায় পৌঁছানোর সবচেয়ে সহজ পথ হচ্ছে ঢাকা-টাঙ্গাইল-বঙ্গবন্ধু সেতু-সিরাজগঞ্জ-নাটোর।
এছাড়াও রেল পথে ঢাকা কমলাপুর রেলষ্টেশন থেকে সরাসরি নাটোরে আসা যায়।
নদী পথে রাজধানী ঢাকার সাথে নাটোর জেলার যোগাযোগ ব্যবস্থা ভাল নয়।